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Risultati di ricerca imperfetti: gli anticorpi possono essere guasti

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Anonim

La ricerca scientifica è valida solo come gli strumenti utilizzati per condurre gli esperimenti.

Quindi, con uno degli strumenti scientifici più comuni che secondo come riferito funzionano costantemente solo il 49% delle volte, molti scienziati sono preoccupati.

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Lo strumento? Anticorpi su misura.

Come gli anticorpi prodotti naturalmente dal sistema immunitario in risposta a un invasore come un batterio o un virus, gli anticorpi personalizzati si legano a specifici bersagli molecolari.

Misurando il grado di legame degli anticorpi, gli scienziati possono determinare se una proteina è presente in un campione di cellule o tessuti o come i livelli delle proteine ​​cambiano in risposta a determinati test.

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Questo aiuta gli scienziati a capire come si sviluppano le malattie e a trovare nuovi modi per trattare o diagnosticare loro.

Ma solo se gli anticorpi funzionano come pubblicizzato.

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"Gli anticorpi devono essere testati per assicurarsi che stiano rilevando la corretta proteina di interesse e solo quella proteina," Deborah Berry, Ph. D., ricercatrice e condirettore di Istopatologia e Tessuto Risorse condivise alla Georgetown University, ha detto a Healthline.

Questa "validazione" può essere fatta dall'azienda che produce l'anticorpo, dal ricercatore o da un laboratorio specializzato come Berry's.

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In che modo gli anticorpi sono difettosi?

Gli anticorpi difettosi si presentano in molte forme.

Un anticorpo può legarsi a proteine ​​diverse dal bersaglio designato. O a nessuna proteina.

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Le condizioni sperimentali - come le soluzioni utilizzate - possono anche influenzare il modo in cui un anticorpo funziona.

Anche lo stesso tipo di anticorpo prodotto in lotti separati - o di aziende diverse - può dare risultati diversi.

Un 'risultato' con un anticorpo può essere molto diverso da un 'risultato' con un altro anticorpo. Deborah Berry, Georgetown University

"In quanto tale, un" risultato "con un anticorpo può essere molto diverso da un" risultato "con un altro anticorpo, anche se eseguito con gli stessi campioni nelle stesse condizioni", ha affermato Berry.

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Gli anticorpi difettosi possono anche creare grossi grattacapi per gli scienziati.

In un caso, evidenziato nella rivista Nature, i ricercatori del Mount Sinai Hospital di Toronto, in Canada, hanno usato un anticorpo proveniente da un kit commerciale di rilevamento delle proteine ​​per creare un test per il cancro del pancreas.

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Alla fine si sono resi conto che l'anticorpo non si lega alla proteina bersaglio. Invece, si attacca a un'altra proteina del cancro.

Il risultato? Due anni di duro lavoro, migliaia di campioni di pazienti e $ 500.000 in fuga.

Uno dei ricercatori ha detto a Nature che, nel tentativo di spostare le loro ricerche, non erano riusciti a garantire che l'anticorpo funzionasse come promesso.

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Sistema di punteggio per gli anticorpi

Quindi, se controllare la qualità degli anticorpi è così importante per l'integrità della ricerca scientifica, chi dovrebbe assicurandosi che accada?

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"In termini di convalida, dipende sia dal produttore / venditore, sia dall'utilizzatore finale, i. e. il ricercatore individuale, "Leonard Freedman, Ph. D., presidente del non profit Global Biological Standards Institute (GBSI), ha detto a Healthline in una e-mail.

Ma non è un grosso segreto tra la comunità scientifica che alcune aziende vendano anticorpi "schifosi".

Ecco perché molti scienziati stanno spingendo per ottenere anticorpi commerciali più efficaci.

"Le aziende devono essere tenute a standard più elevati per garantire che gli anticorpi di scarsa qualità non entrino nel mercato", ha affermato Berry.

Durante un incontro la scorsa settimana ad Asilomar, in California, ospitato da GBSI, più di 100 esperti biomedici hanno offerto una possibile soluzione agli anticorpi inferiori - creare un sistema di punteggio che dica agli scienziati quanto siano affidabili gli anticorpi di un'azienda.

Gli scienziati presenti all'incontro - insieme a rappresentanti dell'industria e del governo - hanno concordato una strategia per creare linee guida per la convalida degli anticorpi di ricerca. Questi standard modelleranno il sistema di classificazione.

Attualmente non esistono linee guida standardizzate e ampiamente accettate per la convalida degli anticorpi.

I partecipanti all'incontro Asilomar sperano che una migliore convalida degli anticorpi farà risparmiare tempo e denaro per la ricerca.

Migliorerà anche la riproducibilità nella ricerca: la capacità degli scienziati di ottenere gli stessi risultati quando eseguono di nuovo un esperimento.

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Migliore formazione per gli scienziati

Anche uscendo dall'incontro è una tabella di marcia per come le aziende anticorpali sarebbero certificate e come gli scienziati possono essere migliori addestrato all'uso degli anticorpi.

Un sondaggio condotto l'anno scorso da GBSI ha concluso che oltre la metà dei ricercatori non erano addestrati sull'importanza della convalida degli anticorpi.

I giovani scienziati erano ancora più inclini a ignorare questo passaggio chiave.

Finora, il sistema di punteggio degli anticorpi rimane sul tavolo da disegno, ma la pressione dagli angoli giusti potrebbe aiutare a spostarlo in avanti.

"In termini di implementazione o conformità degli standard, i finanziatori, i periodici e persino le istituzioni ospitanti dovrebbero svolgere ruoli critici", ha affermato Freedman.

Berry ha detto che questo potrebbe significare richiedere "allo scienziato di dimostrare - sia attraverso la distribuzione di documentazione aziendale o test in-lab - che l'anticorpo utilizzato nell'esperimento rileva in modo appropriato la proteina di interesse. "

Le principali riviste mediche e il National Institutes of Health (NIH) hanno già adottato misure per affrontare il problema della" riproducibilità "."I cattivi anticorpi, però, sono solo un pezzo di questo.

E convalidare e classificare i milioni di anticorpi venduti da dozzine di aziende non sarebbe facile - o economico.

"È costoso prendere tutti gli anticorpi attraverso la piena convalida e l'azienda dovrebbe trasmettere tali costi al cliente", ha affermato Berry. "Il costo della convalida aumenta il costo degli anticorpi e riduce la capacità di un'azienda di competere per i clienti. "

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