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Un virus recentemente scoperto è in agguato nei tuoi intestino

Anonim

C'è un virus segreto che si annida nell'intestino? Probabilmente.

Un nuovo studio fuori dalla San Diego State University (SDSU) ha scoperto che più della metà delle persone sulla terra ha un virus appena scoperto - soprannominato crAssphage - che infetta i batteri comuni dell'intestino noti come Bacteroides. Si pensa che questi batteri siano collegati all'obesità e al diabete. Imparare di più sul virus potrebbe far luce su quelle e altre malattie legate all'intestino.

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Robert Edwards, un professore di bioinformatica presso l'SDSU, ha fatto la scoperta con i suoi colleghi per caso. Lui e Bas E. Dutilh, un professore che è ora al Radboud University Medical Center nei Paesi Bassi, stavano esaminando nuovi virus esaminando i risultati di altri studi.

Quando la coppia ha esaminato il DNA in campioni fecali di 12 persone, hanno notato che tutti i campioni contenevano uno strano cluster di DNA virale. Quando hanno assemblato i pezzi e li hanno confrontati con una lista di virus conosciuti, sono venuti fuori vuoti. (Il software per il cross-assembly che usavano, chiamato crAss, era l'ispirazione per il nome del virus.)

Hanno anche esaminato i database del progetto del microbioma umano (HMP) del National Institute of Health e del database MG-RAST di Argonne National Laboratory, ma non hanno trovato il virus che avevano scoperto.

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Questo è quando John Mokili, un virologo di SDSU, ha usato l'amplificazione del DNA per far crescere molte copie del virus per provare che la sequenza di DNA che Edwards e Dutilh avevano trovato proveniva in realtà da un singolo organismo vivente che esiste in natura. Mokili ha identificato il virus nei campioni originali che compongono il database NIH.

"Non è raro andare alla ricerca di un nuovo virus e trovarne uno", ha detto Edwards in un comunicato stampa. "Ma è molto insolito trovarne uno che ha così tante persone in comune. che è volato per molto tempo sotto il radar è molto strano. " La ricerca è stata pubblicata questa settimana su Nature Communications.

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Poiché il virus è così diffuso, probabilmente non si è evoluto di recente. Edwards ha detto di aver trovato CrAssphage in ogni popolazione che hanno esaminato.

"Per quanto ne sappiamo, è vecchio come gli umani", ha detto Edwards.

Alcune delle proteine ​​in esso contenute sono simili a quelle che si trovano in altri virus. Questo è ciò che ha aiutato i ricercatori a determinare che crAssphage è un batteriofago, un organismo che infetta i batteri e quindi si replica all'interno di essi. CrAssphage prospera infettando Bacteriodes, un batterio intestinale comune. CrAssphage potrebbe essere coinvolto nella gestione del peso a causa del suo effetto su Bacteroides.

I batteri vivono verso la fine del tratto intestinale e probabilmente giocano un ruolo nel legame tra batteri intestinali e obesità.I ricercatori vogliono sapere dove crAssphage si adatta a quel processo. Edwards ha detto che il virus potrebbe mediare l'attività di queste colonie Bacteriodes. Se i ricercatori possono isolarlo, potrebbe essere usato per aiutare a prevenire l'obesità e altre malattie dell'intestino.

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"Questa potrebbe essere la chiave per la medicina dei fagi personalizzata", ha detto Edwards. "Negli individui, potremmo isolare il particolare ceppo del virus, manipolarlo per colpire i batteri nocivi, quindi restituirlo a te. "

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Dutilh ha detto che il risultato è significativo per una serie di motivi.

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"Evidenzia che la componente virale della nostra flora intestinale è poco studiata, simile tra persone totalmente indipendenti, e si evolve più lentamente di quanto si pensasse in precedenza", ha detto a Healthline.

I ricercatori non sanno ancora come viene trasmesso il virus. Non si trova nei bambini, quindi probabilmente non viene trasmesso dalle madri ai bambini.

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Che aspetto ha il virus? Gli scienziati pensano che CrAssphage sia circolare, e molte ricerche indicano che si tratta di un singolo organismo, sebbene sia stato difficile isolarlo.

"Sappiamo che è lì, ma non possiamo ancora catturarlo", ha detto Edwards.

Dutilh ha detto che il team non pensa che il virus sia nocivo perché è stato trovato in molte persone sane, anche se altri tipi noti di batteriofagi causano malattie.

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